Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PARVAQ9NVD7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms