Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms