Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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