Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRC3Q9BY71 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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LRRC3Q9BY71 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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LRRC3Q9BY71 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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LRRC3Q9BY71 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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LRRC3Q9BY71 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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LRRC3Q9BY71 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC3Q9BY71 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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