Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms