Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms