Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAGR1Q9BTK6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms