Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATG101Q9BSB4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms