Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM83CQ9BQN1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms