Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms