Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms