Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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