Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPAP2Q8IXW5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms