Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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