Protein–RNA interactions for Protein: Q86W28

NLRP8, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP8Q86W28 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NLRP8Q86W28 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms