Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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ZBED9Q6R2W3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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ZBED9Q6R2W3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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ZBED9Q6R2W3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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ZBED9Q6R2W3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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