Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms