Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZN7

HCP5, HLA class I histocompatibility antigen protein P5, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCP5Q6MZN7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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