Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms