Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms