Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms