Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms