Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms