Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms