Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A3Q495N2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A3Q495N2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms