Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms