Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms