Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC57Q2TAC2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms