Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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