Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms