Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD2Q16342 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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