Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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