Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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