Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms