Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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