Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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