Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNC3Q14003 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms