Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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ITGA9Q13797 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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ITGA9Q13797 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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ITGA9Q13797 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ITGA9Q13797 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ITGA9Q13797 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ITGA9Q13797 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ITGA9Q13797 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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