Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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