Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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PEX6Q13608 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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PEX6Q13608 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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PEX6Q13608 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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PEX6Q13608 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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PEX6Q13608 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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