Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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DUSP4Q13115 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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DUSP4Q13115 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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DUSP4Q13115 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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