Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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