Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms