Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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