Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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