Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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