Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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