Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms