Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms