Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms